В поликлинике ежегодно выполняется более 125 000 обследований. В поликлинике мощностью 450 посещений в смену прием больных проводится в две смены. В республике работают 12 филиалов ГАУЗ РКОД Минздрава РБ.
В составе Республиканского клинического онкологического диспансера семь хирургических отделений: торакальное отделение, абдоминальное отделение, отделения онкоколопроктологии, маммологии, онкоурологии, онкогинекологии, отделение «голова-шея». Также два отделения противоопухолевой лекарственной терапии в круглосуточном стационаре и амбулаторное отделение противоопухолевой лекарственной терапии с дневным стационаром, структурное подразделение амбулаторное отделение противоопухолевой лекарственной терапии с дневным стационаром в ГБУЗ РБ КБ №1 г. Стерлитамак .
Амбулаторное отделение общей онкологии с паллиативными койками, два радиологических отделения в круглосуточном стационаре, амбулаторное радиологическое отделение с дневным стационаром, отделение медицинской физики и радиационной безопасности, отделение лучевой топометрии и диагностики, республиканский центр брахитерапии и 11 вспомогательных отделений: рентгендиагностики, эндоскопическое, УЗ-диагностики, радиоизотопной диагностики, радиологические отделения №4 и №5, клинико-диагностическая лаборатория, анестезиолого-реанимационное отделение, трансфузиологический кабинет, операционный блок, патологоанатомическое отделение.
Республиканский клинический онкологический диспансер располагает уникальным кадровым составом. В коллективе 1104 специалиста, из них 234 врача, 479 медицинские сестры, пять докторов и 60 кандидатов медицинских наук. Три врача удостоены звания «Лучший онколог РФ», девять – «Лучший онколог РБ». Врачебный персонал прошел профессиональную подготовку в ведущих институтах и специализированных центрах России и Европы.
На базе Республиканского клинического онкологического диспансера работают кафедра хирургии и онкологии с курсами ИПО онкологии и патологической анатомии, возглавляемая
доктором медицинских наук, профессором, членом-корреспондентом Академии наук Республики Башкортостан Ш.Х. Ганцевым, а также кафедра лучевой диагностики Башкирского государственного медицинского университета под руководством доктора медицинских наук, профессора И.В. Верзаковой. За последние пять лет в практику клинических отделений внедрено более 50 новых методов диагностики и лечения онкобольных, разработанных сотрудниками центра. Ведущие ученые кафедры выполняют большую работу и активно внедряют в практическое здравоохранение научные достижения.
Для осуществления масштабной и высокотехнологичной медицинской помощи диспансер располагает хорошей материально-технической базой. Медицинское оборудование, поставленное в республику в рамках реализации мероприятий национального проекта «Здоровье», позволяет обеспечить доступность лечебно-диагностической онкологической помощи в муниципальных образованиях, оптимизировать лечебно-диагностический процесс, поднять на новый уровень качество проведения диагностических мероприятий по выявлению онкологических заболеваний.